publicar sitio en servidor linux

Hola a todos, tengo unas dudas y me gustaría que me puedan ayudar... estoy tratando de subir un sitio web hecho en php a un servidor que tiene instalado red hat 3.2.3-6 en este servidor ya esta corriendo un sitio con un dominio wwww.sitoweb.com adicionalmete se ha creado otro dominio www2.sitioweb.com en el cual debo hacerlo apuntar a mi directorio que contiene mi sitio hecho en php, en el sevidor ya esta instalado todo lo que necesito (apache,postgres y php, tambien tengo creada mi base), ademas ya subì todo los archivos del sitio a publicar y ya le di los permisos wrxwrxwrx a mi directorio, pero no sè como apuntar el www2.sitioweb.com a mi directorio sin afectar al otro dominio?? Para subir mis archivos utilice fillezilla y en su configuracion avanzada he leido que en su que tiene un campo "carpeta de almacenamiento" donde se le debe colocar "public_html" lo que no sè es que si al hacer esto estaria borrando todos los archivos que se muestran con el dominio www.sitioweb.com Les agradezco su atención, esperando su pronta respuesta. -- Saludos, Miguel Espinoza Mail: miespinoza(a)gmail.com