Ich habe es gerade mal unter FC3 Und FC4 getestet ohne Probleme. Aber das
dürfte auch die Ursache sein, warum dein config script "verkackt"
/usr/include/GL/glext.h!!!
Haste die neuste Version von xorg-x11-devel??
Unter FC4 habe ich Version 6.8.2-37
Kannste ja mal die 1. paar Zeilen von /usr/include/GL/glext.h rüberreichen